De acordo com o site MaisFutebol, Pepe vai ficar afastado dos relvados entre 4 a 6 semanas, falhando assim pelo menos 8 jogos: com o Portimonense, o Benfica, o Santa Clara e o Paços Ferreira, para a Liga, com o Bayer Leverkusen, o Brugge e o At. Madrid, para a Liga dos Campeões, e com o Anadia, para a Taça de Portugal.
Segundo informação prestada pelo FC Porto, confirmando a informação avançada pelo técnico Sérgio Conceição, em conferência de Imprensa, Pepe encontra-se em tratamento médico, após ter sofrido uma entorse no joelho esquerdo, com lesão do ligamento colateral interno.